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2026/4/6

【バイオものづくり】NITE、NEDO事業で特性情報から微生物種を検索できる国内初の統合データベース開発・公開。研究者の負担を軽減して、スマートセル構築の迅速化

　NEDO（新エネルギー・産業技術総合開発機構）の委託事業「カーボンリサイクル実現を加速するバイオ由来製品生産技術の開発」事業の一環として、製品評価技術基盤機構（NITE）は、このたび、微生物の特性情報をもとに、世界中の主要なデータベースで一般公開されている微生物種の中から関心のある特性を持つ微生物を横断的に検索可能なデータベース「微生物選定支援ツール」を開発し、運用を開始した。
　このデータベースは、一般公開されている5つの国際的に主要なデータベースに収載されている微生物株情報約6万7000件から、培養温度、培養pH、酸素要求性などの微生物に関する重要な7種類の特性情報を収集し、微生物種ごとに整理・統合したデータベースで、特性情報から微生物種を日本語で横断的に検索することが可能。特性情報から微生物種を検索できる統合データベースは、国内初のもの。
　従来は研究者が個別のデータベースで1つひとつデータを見ながら微生物を探索する必要があったが同本データベースにより、日本でスマートセルを構築しようとする研究者が、関心のある特性を持つ微生物を探索しやすくなる。今後、利用者からのニーズに合わせて機能の拡充を図る。

背景
　バイオものづくりの分野では、原料から最終製品に至るボトルネック解消のため、物質生産能力を人工的に最大限向上させた生物細胞「スマートセル」を利活用する動きが活発になっている。スマートセルの開発には手間と時間がかかるため、スタート時に作りたい物質や生産条件に適合した微生物を効率的に選定することが重要。しかし、従来は培養温度や培養pH、酸素要求性などの特性情報は複数のデータベースに分散していたため、個別のデータベースで1つひとつデータを見ながら微生物を探索し、選定する必要があり、研究者にとって大きな負担となっていた。
　こうした背景の下、NEDOは2020年度から「カーボンリサイクル実現を加速するバイオ由来製品生産技術の開発」事業で、産業用スマートセルの創出に向けたバイオ資源の拡充や、その探索のための基盤技術の開発を行っている。その一環として、NITEと共同で、微生物探索を効率化するためのデータベースの開発に取り組んでいる。

今回の成果
（1）微生物選定支援ツールの開発
　NBRC^※1オンラインカタログ（約2万1000件の株情報を収載）、JCMオンラインカタログ（約9000件）、JGI GOLD（約1万4000件）、BV‑BRC（約1万4000件）、TEMPURA（約9000件）など、複数のデータベースに収載されている微生物株情報約6万7000件から、培養温度や培養pH、酸素要求性など7種類の特性情報を、微生物種ごとに整理・統合することで、日本語による微生物の選定や培養条件の検討を支援するデータベースを構築した。特性情報から微生物種を検索できる統合データベースは、国内初^※2となる。
　また、培養温度と培養pHについては分布をヒストグラムで表示するとともに、検索結果の件数を随時表示することで、より視覚的な探索を可能にした。
　このデータベースを活用することで、特定の性質（培養温度、培養pH、酸素要求性、好塩性など）を持つ微生物を効率よく調査することができる。
（2）微生物選定支援ツールの公開
　今回開発したデータベースは、2026年2月にNITEが運営している生物資源データプラットフォーム（DBRP）上で公開している。

今後の予定
　同データベースにより、国内でスマートセルを構築しようとする研究者が、関心のある特性を持つ微生物を世界の主要なデータベースから横断的に探索することが可能になる。今後、NEDOとNITEは利用者からのニーズに合わせて機能の拡充を図る。
※1　NBRC
　NITE Biological Resource Centerの略で、NITEが運営している生物資源センター（BRC）のことす。
※2　国内初
　2026年3月現在で、NITEの調べ。

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